A día de hoy, la prueba diagnóstica definitiva para la detección de diferentes tipos de cáncer es la biopsia. Se toma una muestra del tejido bajo estudio, se procesa (mediante las técnicas de fijación, inclusión, corte y tinción) y se analiza por el patólogo mediante un microscopio. Debido a la gran carga de trabajo actual y gracias a la tecnología Whole Slide Image (WSI), una práctica común es el escaneo digital de dichas muestras que permita un análisis automático de las mismas mediante procesado de imagen y algoritmos de inteligencia artificial.
Para la fase de entrenamiento de estos modelos predictivos se requiere de muestras etiquetadas o anotadas por patólogos expertos. Las imágenes digitalizadas mediante la tecnología WSI son imágenes gigapixel que ocupan entre 1-2 GB de memoria en disco. Es por ello que cargarlas de manera estática en memoria se hace inviable, dificultando así el acceso y visualización de dichas imágenes. Para dar solución a este problema, se ha desarrollado GIGAVISIÓN, un sistema que permite el marcado de regiones tumorales sin carga computacional. De este modo se facilita el marcado de imágenes por parte de los patólogos. Entre sus características se encuentra:
- Se trata de una herramienta web que permite la visualización de imágenes gigapixel desde cualquier parte del mundo. Se trata de una herramienta colaborativa que fomenta el trabajo en equipo de patólogos de diferentes países y que permite así disponer de varias opiniones en la anotación de patrones tumorales.
- La herramienta permite el aumento en resolución de las imágenes sin que esto implique una pérdida de calidad. Cada vez que se escoge un determinado nivel de zoom, la aplicación carga de forma dinámica la imagen en dicho nivel de aumento a máxima resolución.
- La herramienta web incluye diversas funcionalidades para poder realizar la tarea de anotación de manera cómoda y sencilla para el usuario, bien empleando un lápiz de tablet o bien utilizando el puntero del ratón. Se incluye la funcionalidad de marcación libre y marcación a partir de una malla de puntos.
- Por último, la herramienta se comunica con una base de datos mySQL que mantiene actualizados y organizados los datos. Al realizar una anotación y presionar el botón de salvar anotación, esta se almacena de forma automática en la tabla relativa al usuario autor de dicha anotación.
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